Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms