Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267 ms