Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma2P49722 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma2P49722 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma2P49722 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma2P49722 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms