Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms