Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl5P47962 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl5P47962 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl5P47962 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms