Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms