Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rph3aP47708 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3aP47708 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms