Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms