Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf1P46099 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf1P46099 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms