Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sipa1P46062 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms