Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-6P43688 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-6P43688 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms