Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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