Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LtbP41155 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LtbP41155 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LtbP41155 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LtbP41155 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LtbP41155 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbP41155 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbP41155 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms