Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms