Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TfamP40630 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TfamP40630 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TfamP40630 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms