Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd9P40240 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd9P40240 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd9P40240 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms