Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms