Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms