Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms