Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms