Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppm1bP36993 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppm1bP36993 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppm1bP36993 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms