Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprkP35822 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms