Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6dP35459 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6dP35459 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms