Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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