Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pola1P33609 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pola1P33609 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms