Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp13P33435 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms