Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms