Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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