Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms