Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms