Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atxn10P28658 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms