Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms