Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Hoxd10P28359 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Hoxd10P28359 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Hoxd10P28359 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd10P28359 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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