Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv4P28322 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv4P28322 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Etv4P28322 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms