Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms