Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms