Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpl3P27659 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl3P27659 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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