Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CftrP26361 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CftrP26361 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CftrP26361 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CftrP26361 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CftrP26361 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CftrP26361 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms