Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxd12P23812 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms