Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PparaP23204 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PparaP23204 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PparaP23204 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PparaP23204 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PparaP23204 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms