Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmbsP22907 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms