Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms