Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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