Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RargP18911 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RargP18911 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RargP18911 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RargP18911 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RargP18911 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms