Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms