Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxb1P17919 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxb1P17919 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxb1P17919 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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