Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms