Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sptan1P16546 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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