Protein–RNA interactions for Protein: P16332

Mut, Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MutP16332 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MutP16332 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MutP16332 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MutP16332 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MutP16332 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MutP16332 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms