Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms